メールの機能がOS X版と同等に【メール】
検索機能が強化
属性で抽出可能
メール検索では、あるはずのメールが見つからないことが多かった。iOS 9ではより速く正確な検索が可能になっている。キーワードを入れると件名などで絞り込みも可能。
アイクラウド・ドライブから添付
（１）ファイルを添付
これまでは写真やビデオのみだったが、アイクラウド・ドライブに保存された一般的なファイルも添付可能になった。
（２）メールドロップ対応
メールドロップに対応するので、プロバイダの容量制限を受けずに5GBまでのファイルが送れる。
添付ファイルに書き込み
マークアップ
OS X版のメールと同様に添付したファイルに書き込みが行える。ペンで囲みを入れたり、ルーペで拡大、テキストの記入も可能だ。
交通機関に対応したが日本は未対応【マップ】
交通機関に対応
（１）レイヤーを選択
新たに［交通機関］というレイヤーが追加された。対応している都市なら公共交通機関が利用できる。
（２）乗り換え案内
地下鉄などの乗り換え案内に対応する。非対応地域では、外部アプリとの連係で補完される。
（３）行き先を先読み
連絡先などを参照して経路検索の出発地、到着地の候補として、自宅、勤務先、よく使う項目が表示されるようになった。
探しやすく整理しやすいフォトアルバムに【写真】
フィルムストリップ
前後のブラウズが簡単に
表示した写真の下にフィルムストリップ的なサムネイルが表示されるようになった。前後関係がわかりやすい。
一括選択が可能に
スワイプで選択
複数の写真を選んで共有、削除、アルバム作成の際は一枚一枚タップしなければならなかったが、スワイプすることでたくさんの写真を選べるようになった。
セルフィーとスクリーンショット
自動生成のアルバム
フェイスタイムカメラで撮影した写真が自動的に［セルフィー］アルバムに、スクリーンショットも［スクリーンショット］アルバムに自動的に入るようになった。おそらく画像ファイル自体にメタデータがあらかじめ埋め込まれており、iOS 9以前の写真も整理される。
キーワードを検索
ジオタグや日時で検索
iOS 8でも搭載されていたが、ちゃんと動くようになった。Siriにも対応するので「（場所）で撮った写真」「（時期）に撮った写真」などで検索できる。
ソフトキーに連動して大文字・小文字がタイプする前にわかる
【キーボード】
デフォルトが小文字に
シフトキーで変化
これまで英語キーボードは常に大文字だった。Mac用キーボードが長年大文字だったことが原因だろうが、ソフトウェアキーボードらしく、タイプすると入力できる文字種が表示されるようになった。シフトキーやキャプスロックがかかっていると大文字、そうでないときは小文字で表示される。ベータ版では、iPadのようなトラックパッドモードが搭載されていたが、正式版ではなくなっている。